Департамент прогнозирования и организации бюджетного процесса является структурным подразделением Минобрнауки России.

Основными полномочиями Департамента прогнозирования и организации бюджетного процесса являются:

подготовка доклада о результатах и основных направлениях деятельности Минобрнауки России как субъекта бюджетного планирования;

анализ и экспертиза прогнозов развития образовательной, научно-технической и инновационной сфер;

координация формирования предложений Минобрнауки России в части расходов инвестиционного характера как субъекта бюджетного планирования по показателям ведомственной, функциональной и экономической классификации при подготовки проектов федерального бюджета на очередной финансовый год, перспективного финансового плана, федеральных целевых программ и федеральной адресной инновационной программы;

ежемесячное представление оперативной информации по исполнению бюджета в Счётную палату Российской Федерации;

финансирование закупки научных приборов и оборудования для государственных научных центров, ведущих научных организаций и образовательных учреждений Российской Федерации в соответствии с показателями сводной бюджетной росписи на очередной финансовый год;

проведение правовой экспертизы законодательных и иных нормативных правовых актов, подготавливаемых структурными подразделениями Минобрнауки России или поступивших в установленном порядке в Министерство.

Департамент прогнозирования и организации бюджетного процесса возглавляет Директор, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Министром образования и науки Российской Федерации.